天智天皇の石切り場跡

本堂正面のすぐ下方にある石切り場跡には、天然記念物「硅灰石」が道沿いに露出しており、15か所の採石痕があります。近年、ここから切り出された石が、飛鳥の川原寺中金堂（7世紀前半～半ば頃創建か）の礎石に使用されていることが明らかとなりました。また、境内の別の場所から白鳳期の瓦も発掘されており、石山寺の創建年とされる天平19年（747）以前に、すでに前身となる寺院が存在したことを証明する貴重な遺跡といえます。